Der Geschäftsleitung gehören die Direktorin und ihre direkt Unterstellten an. Es sind dies: (obere Reihe von links nach rechts) Luciano Bergamin, Leiter Informatikdienste, Roland Meyer, Generalsekretär, Franziska Zimmermann, Leiterin Personalamt, Hanspeter Müller, Leiter Schul- und Büromaterialzentrale, Fernand Raval, Liegenschaftsverwalter, (untere Reihe von links nach rechts) Moritz Jäggi, Steuerverwalter, Gemeinderätin Barbara Hayoz und Daniel Schaffner, Finanzverwalter.
Die Geschäftsleitung ist zuständig für die strategische Ausrichtung der FPI. Sie kommt regelmässig zusammen und widmet sich strategischen, personellen und finanziellen Themen der Direktion.